当前位置:首页 > 技术 > 正文内容

芯空一号实现的单细胞空间转录组检测数据_abio生物试剂品牌网

abiopp3个月前 (05-28)技术8

Visium空间转录组测序,作为第一个商业化的空间转录组检测平台,这些年来极大地促进了空间组学的发展,也助力了很多高影响因子研究成果的发表。然而,第一代产品55μm尺度,OCT冷冻样本实验方案,还是影响了大量临床石蜡样本的检测;第二代CytAssist平台的升级,不光实现了对石蜡组织样本的拓展,也解决了样本用普通玻璃片贴片再进行运送的问题;第三代Visium HD产品的升级,再次突破了检测分辨率的局限,直接从55μm提高了到2μm分辨率。虽然从分辨率上来说,2μm的大小远小于单个细胞的直径,但是从分析角度来说,由于没有更多的方法协助,还是做不到单个细胞的分辨率。如果有人跟你说,HD就是单细胞空间转录组检测,放心,他绝对在忽悠人。

然而,要想实现HD数据单细胞空间分辨率的梦想还是要有的,这会儿还真能实现了。利用上机样本的HE染色图片,结合数据2μm尺度的分辨率,我们用新的算法软件,实现了对HD数据进行细胞分割的想法。终于,在这个动荡混乱的时代,我们还是在艰苦奋斗中有了一点小的突破。终于,在AI智能时代来临之际,全转录组单细胞分辨率的Visium空间产品问世了。

让我们一起来看一下HD数据实现的单细胞空间转录组数据:

分析一

图A,HE染色形态图;图B,算法识别到的细胞形态图;图C,图A中红框区域识别到的分割局部图

分析二
 

图A,细胞分群全局图;图B,局部区域不同Cluster分布;图C,细胞注释全局图;图D,局部区域各细胞类型分布

分析三
 
图A,肠上皮细胞Enterocyte marker Apoa1的表达分布总图;图B,Apoa1的表达分布局部图;图C,对应图B区域的细胞注释图

尖端生命科学与生物医药创新技术服务中心(CITC)-SBC服务平台部深耕组学研究20年,无论是芯片还是测序,单细胞亦或是空间组学,经验丰富的我们与“芯空一号”,让您的生命科学研究更上一层楼。欢迎各位老师前来咨询!

本站“ABIO生物试剂品牌网”图片文字来自互联网

如果有侵权请联系微信: nanhu9181 处理,感谢~

相关文章

利用等离子体处理优化3D打印PEEK植入物的细胞反应_abio生物试剂品牌网

利用等离子体处理优化3D打印PEEK植入物的细胞反应_abio生物试剂品牌网

聚醚醚酮(PEEK)因其出色的机械性能和生物相容性,在牙科和骨科植入领域得到广泛应用。尽管如此,PEEK的生物惰性表面限制了其与骨组织的有效结合。传统上,通过涂覆羟基磷灰石(HA)等生物活性材料来提高...

GelMA水凝胶微球用于再生医学研究的相关应用_abio生物试剂品牌网

GelMA水凝胶微球用于再生医学研究的相关应用_abio生物试剂品牌网

通过微流控乳液法、静电微滴等技术制备出的GelMA微球 不仅保留了GelMA优异的生物相容性和生物活性,而且可作为单独的细胞培养单元或组装成多孔支架或模拟仿生微环境,进而应用于细胞3D培养、药物递...

纳微快速纳米药物制备系统在制备脂质mRNA-LNP递送载体中的新应用_abio生物试剂品牌网

纳微快速纳米药物制备系统在制备脂质mRNA-LNP递送载体中的新应用_abio生物试剂品牌网

近日,浙江大学刘帅课题组使用 纳微仪器Nanowetech的NWDPS快速纳米药物制备系统制备单组分阳离子脂质mRNA,静脉给药后靶向脾脏T细胞。   NWDPS快速纳米药...

血管生成实验步骤及常见问题解析_abio生物试剂品牌网

血管生成实验步骤及常见问题解析_abio生物试剂品牌网

血管生成实验怎么做?NEST来胶你!   “1971 年,Judah Folkman 教授提出 “肿瘤生长和转移依赖于血管新生” 理论,认为新血管的形成对于肿瘤生长和转移至关重要。”...

病毒疫苗检测与质量控制中,MetaSPR技术如何确保疫苗高效安全?_abio生物试剂品牌网

病毒疫苗检测与质量控制中,MetaSPR技术如何确保疫苗高效安全?_abio生物试剂品牌网

在与病毒的斗争中,我们如何确保疫苗的安全性与有效性?如何为公众健康、畜牧业、宠物健康提供坚实保障?答案在于严格的病毒疫苗检测与质量控制。MetaSPR技术以其高精度、高灵敏度的监测能力,成为了这一环节...