DAP-seq助力揭示杂交枫香再生调控新机制_abio生物试剂品牌网

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2025年6月,北京林业大学张金凤团队在《New Phytologist》(IF=8.1)上发表了一篇题目为“BZR2-GRF5 acts as a hub module in regulating in vitro regeneration through brassinosteroid–auxin crosstalk in hybrid sweetgum”的研究论文,本文借助DAP-seq技术,揭示了BZR2-GRF5转录调控模块通过组织特异性调控生长素外排基因LsfWAG2,介导油菜素内酯(BR)与生长素(IAA)信号互作,双向调控体细胞胚胎发生(SE)与器官再生的分子机制,为木本植物再生机制研究与遗传改良提供了全新视角。 研究背景 木本植物离体再生是种质资源扩繁、保存及遗传改良的关键技术,主要通过体细胞胚胎发生(SE)和器官发生两条途径实现。枫香是重要林木资源,杂交枫香因生长快、木材密度高,具有显著杂种优势,但其再生体系存在愈伤诱导率低、芽再生效率低等问题。油菜素内酯(BR)与生长素是调控植物再生的关键激素,BZR转录因子通过靶向生长素信号组分(如PIN, ARF)影响激素合成与运输。此前研究发现外源epiBR需与生长素联用才能诱导杂交枫香SE,提示BZR基因可能是再生通路的关键调控因子,但其作用机制尚不清楚。 技术路线 研究结果 本研究利用Hidden Markov 模型从杂交枫香基因组中鉴定出8个BZR家族基因,组织特异性表达谱显示LsfBZR1/2在胚性愈伤组织(EC)及胚胎发生阶段特异性高表达。通过酵母双杂交(Y2H)、荧光素酶互补成像(LCI)、蛋白Pull-down、亚细胞定位多种实验,证实LsfBZR2与生长调节因子LsfGRF2/3/5存在直接蛋白互作,且发生在细胞核内。其中LsfGRF5互作效应最为显著。GRF家族是植物生长发育的关键转录因子,提示LsfBZR1/2可能通过与GRF蛋白互作调控再生。 图1 杂交枫香中LsfBZR1/2的表达模式及序列分析。 为了进一步验证BZR2-GRF5模块功能,构建了LsfBZR2及LsfGRF5过表达株系。表型分析表明,LsfBZR2-OE、LsfGRF5-OE株系均表现为鲜重增加;体细胞胚胎数量减少,且异常胚胎比例显著升高;再生芽生长速率加快且形成密集芽簇。qRT-PCR显示过表达株系基因表达显著上调,且植株表型正常,证实该模块对器官发生有正向调控作用。 图2 过表达LsfBZR2促进杂交枫香愈伤组织增殖并抑制其胚胎发生能力。 图3 过表达LsfBZR2正向调控杂交枫香离体器官发生中的芽再生。

图4 LsfBZR2与杂交枫香中的LsfGRF2、LsfGRF3和LsfGRF5发生互作。

图5 LsfGRF5增强杂交枫香的愈伤组织增殖能力,同时抑制体细胞胚胎的形成。

图6 过表达LsfGRF5促进杂交枫香的芽再生。
为了鉴定LsfBZR2调控的下游基因,作者采用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术来识别该转录因子结合的基因组DNA元件。结果显示LsfBZR2在36,582个基因组位点高度富集,涵盖8,454个基因。其中12.2%位于启动子区域,核心结合基序为‘CACGTG’。GO富集结果表明,与LsfBZR2蛋白结合位点相关的基因主要富集在锌离子稳态维持、分生组织发育、表观遗传学、减数分裂、乙醛酸循环和脱落酸代谢途径。与RNA-seq数据联合分析筛选出457个受LsfBZR2调控的差异基因,其中生长素外排载体基因LsfWAG2(Lsf07G005650)被确认为直接靶基因。qRT-PCR与LC-MS/MS结果显示,在SE途径中,LsfBZR2过表达抑制LsfWAG2表达,导致IAA积累,促进愈伤增殖;在器官发生途径中,LsfBZR2激活LsfWAG2表达,加速生长素外排使IAA水平降低,从而促进芽原基形成。酵母单杂交(Y1H)与双荧光素酶报告实验(DLR)证实,LsfBZR2直接结合启动子区并调控其转录活性。 图7 杂交枫香中LsfBZR2可结合LsfWAG2基因启动子以调控生长素运输。 本研究首次建立了杂交枫香中BR-生长素信号互作的分子调控模型:BZR2-GRF5模块通过差异化调控LsfWAG2表达,在SE中维持高生长素环境促进愈伤增殖,在器官发生中降低生长素水平以加速芽再生,形成组织特异性的双向调控机制。这一发现为木本植物再生效率的遗传改良提供了新靶点,并揭示了BR-生长素互作在组织特异性发育中的精准调控机制。 图8 LsfBZR2-LsfGRF5模块介导生长素信号调控杂交枫香植株体外再生的工作模型。
 
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