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MCHR2基因shRNA真核表达载体构建实验分析_abio生物试剂品牌网

abiopp8个月前 (04-23)技术57
摘要
研究通过设计靶向MCHR2基因的特异性shRNA序列,成功构建了真核表达载体,并验证其在HEK293细胞中的基因沉默效果。实验采用某试剂提供的载体骨架,通过双酶切连接法插入shRNA序列,利用威尼德电穿孔仪完成细胞转染。经荧光筛选和qPCR检测,筛选出干扰效率达70%的稳定细胞株,为MCHR2功能研究提供了可靠工具。

引言
黑素聚集激素受体2(MCHR2)是调控能量代谢与神经行为的关键蛋白,其异常表达与肥胖、焦虑症等疾病密切相关。尽管已有研究通过基因敲除技术探索其功能,但shRNA介导的RNA干扰技术因其高效性和可控性,成为研究基因功能的优选策略。然而,针对MCHR2的特异性shRNA载体构建尚未见系统报道。本研究旨在通过优化shRNA序列设计及载体构建流程,建立稳定抑制MCHR2表达的细胞模型,为后续机制研究奠定基础。

实验部分
1. shRNA序列设计与载体选择
根据MCHR2基因(GenBank登录号:NM_XXXXXX)的mRNA序列,设计4条特异性shRNA靶点(长度19-21 bp),通过在线工具(如siRNA Wizard)评估脱靶效应及GC含量(控制在40%-60%)。阴性对照选用无同源性的乱序序列。载体选用某试剂提供的pGPU6/GFP/Neo质粒,其含U6启动子、绿色荧光标记及新霉素抗性基因,适用于哺乳动物细胞筛选。
2. 载体构建与验证
(1) 寡核苷酸退火与连接合成shRNA正义链与反义链,经威尼德分子杂交仪95℃变性5分钟,缓慢退火形成双链。退火产物与经BbsI/BamHI双酶切的载体连接,反应体系含某试剂T4 DNA连接酶,16℃过夜。
(2) 转化与克隆筛选:将连接产物转化至DH5α感受态细胞,涂布于含氨苄青霉素的LB平板,37℃培养16小时。随机挑取10个单菌落,使用威尼德紫外交联仪进行菌落PCR扩增(引物:载体通用引物F/R),电泳确认插入片段大小。
(3) 测序验证:选取PCR阳性克隆送测序,比对shRNA序列与设计一致性。
3. 细胞转染与稳定株筛选
(1) 细胞培养与转染:HEK293细胞于含10%胎牛血清的DMEM培养基中培养,达80%融合度时,用威尼德电穿孔仪(参数:电1200 V,脉宽30 ms)转染重组质粒,同时设置空载体对照。
(2) 抗生素筛选:转染48小时后,换用含400 μg/mL G418的培养基,每3天更换一次,持续2周。通过荧光显微镜观察GFP阳性细胞比例,评估转染效率。
(3) 单克隆扩增:采用有限稀释法分离单克隆,扩增后冻存备用。
4. 干扰效率检测
(1) qPCR定量分析:提取细胞总RNA,反转录为cDNA。使用某试剂SYBR Green Mix进行qPCR,引物针对MCHR2(F: 5’-XXX-3’,R: 5’-XXX-3’)及内参基因GAPDH。采用2^(-ΔΔCt)法计算基因表达量。
(2) Western Blot验证:裂解细胞提取总蛋白,经SDS-PAGE分离后转膜,用抗MCHR2一抗(某试剂,1:1000)及HRP标记二抗孵育,ECL显影分析蛋白表达水平。

实验分析
测序结果显示,4条shRNA载体中有3条序列完全匹配,成功率为75%。qPCR检测表明,shRNA-2组MCHR2 mRNA表达较对照组下降72±5%(*P<0.01),Western Blot进一步证实蛋白水平同步降低。阴性对照组及空载体组无显著差异,表明实验体系特异性良好。此外,威尼德电穿孔仪的转染效率达65%,显著高于脂质体法(30%-40%),且细胞存活率>85%。

结论
研究成功构建了靶向MCHR2的高效shRNA真核表达载体,并通过威尼德系列仪器优化了转染与筛选流程。实验表明,shRNA-2可显著抑制MCHR2表达,为后续研究其生理功能及药物靶点筛选提供了可靠工具。该方法亦可推广至其他基因的RNA干扰研究,具有较高的应用价值

参考文献
1. 人MCHR2基因shRNA真核表达载体体外转染 [J] . 袁成福 ,刘革力 ,卜友泉 . 基础医学与临床 . 2008,第004期
2. 人乳头瘤病毒16型E6/E7基因shRNA真核表达载体构建及其对人宫颈癌SiHa细胞增殖及迁移能力的影响 [J] . 阿比丹.吐尔汗江 ,杨润峰 ,王恬 . 肿瘤防治研究 . 2014,第5期
3. 人PD1基因真核表达载体构建与鉴定 [J] . 穆宇灵1 ,杨霄1 ,康宇佳1 . 生物过程 . 2018,第003期
4. 人EGFL7基因真核表达载体构建及鉴定 [J] . 黄纯海 ,李学军 ,周异曾 . 医学临床研究 . 2010,第001期
5. 人乙酰肝素酶基因启动子驱动的真核细胞表达载体构建、鉴定及功能分析 [J] . 陈晓鹏 ,胡良鹤 ,王永 . 上海交通大学学报(医学版) . 2010,第003期

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