当前位置:首页 > 技术 > 正文内容

通过PCR反应程序优化对反应时长进行极致压缩_abio生物试剂品牌网

abiopp3个月前 (06-17)技术11

“激水之疾,至于漂石者,势也”——《孙子兵法》。说只要速度足够快,石头就能漂在水面。上个月我们聊了一下降低退火变温速率(PCR反应程序优化之缓)对PCR结果的优化,今天换个方向,聊聊如何把PCR反应时长进行极致缩。

在聊压缩时长之前,需先对试管(Tube)/模块(Block)控温;普通/快速模式几个概念进行简介。下面以柏恒Q9606为图例进行说明。


图1

模块控温:反应升降温时,以模块的实时温度为准。
试管控温:反应升降温时,以反应管内试剂的实时温度为准。


图2


图3

实验编辑完成后,点击运行按钮会弹出提示框(如图2),选择快速模式还是普通模式。

以图3程序为例说明:
快速模式:仪器运行的升降温速率为8℃/s,标示升降温速率的全额运行实验。
普通模式:仪器运行的升降温速率为4℃/s,标示升降温速率的半额运行实验。

不同的应用场景选择不同的反应模式组合,下面来分享一下如何调试快速试剂的反应程序。

首先,仪器运行设置选择快速模式+模块控温的组合将反应时长进行极致压缩。其次,在总时长不变的前提下合理分配循环段变性与退火延伸的时长。最后,在其次筛选出可用反应程序的基础上进行微调,再一次缩短反应段的时长或在总时长允许的条件下适当延长反应段的时长以达到最优的反应效果。

因为快速试剂所用的扩增酶相较于普通试剂的酶来说有着更为快速的延伸速度,所以在设置退火延伸段反应时长时可以进行大幅度的压缩。在压缩变性反应时长时须注意,因为选用的是模块控温,如果变性时长过短会造成试剂的实际温度不足95℃或95℃维持时长不够而造成模板的解双链不充分进而影响信号的积累,所以变性反应段的时长不宜过度极端。

柏恒Q9600系列可提供最快8℃/sec的升降温速率,且具备等温差梯度功能(如图4),满足常规试剂开发、检测的同时也为快速试剂提供了一个很好的反应平台。


图4

本站“ABIO生物试剂品牌网”图片文字来自互联网

如果有侵权请联系微信: nanhu9181 处理,感谢~

相关文章

纳微快速纳米药物制备系统在制备脂质mRNA-LNP递送载体中的新应用_abio生物试剂品牌网

纳微快速纳米药物制备系统在制备脂质mRNA-LNP递送载体中的新应用_abio生物试剂品牌网

近日,浙江大学刘帅课题组使用 纳微仪器Nanowetech的NWDPS快速纳米药物制备系统制备单组分阳离子脂质mRNA,静脉给药后靶向脾脏T细胞。   NWDPS快速纳米药...

小鼠原代小肠类器官培养实验步骤及应用指南_abio生物试剂品牌网

小鼠原代小肠类器官培养实验步骤及应用指南_abio生物试剂品牌网

应用指南 | 小鼠原代小肠类器官培养实验   #应用指南# 2009 年,Hans Clevers 及其团队利用 Lgr5+ 肠干细胞在体外培养出了三维小肠类器官结构。这种结...

血管生成实验步骤及常见问题解析_abio生物试剂品牌网

血管生成实验步骤及常见问题解析_abio生物试剂品牌网

血管生成实验怎么做?NEST来胶你!   “1971 年,Judah Folkman 教授提出 “肿瘤生长和转移依赖于血管新生” 理论,认为新血管的形成对于肿瘤生长和转移至关重要。”...

病毒疫苗检测与质量控制中,MetaSPR技术如何确保疫苗高效安全?_abio生物试剂品牌网

病毒疫苗检测与质量控制中,MetaSPR技术如何确保疫苗高效安全?_abio生物试剂品牌网

在与病毒的斗争中,我们如何确保疫苗的安全性与有效性?如何为公众健康、畜牧业、宠物健康提供坚实保障?答案在于严格的病毒疫苗检测与质量控制。MetaSPR技术以其高精度、高灵敏度的监测能力,成为了这一环节...

躯干伸肌动作电位传导速度与高密度肌电图的频谱参数之间的关系_abio生物试剂品牌网

躯干伸肌动作电位传导速度与高密度肌电图的频谱参数之间的关系_abio生物试剂品牌网

引言 躯干伸肌(Trunk extensor muscles)是支撑和稳定脊柱的重要肌肉群,当人们进行长时间或高强度活动时,这些肌肉易疲劳。 了解躯干伸肌耐力及其肌肉电活动之间的关系,对于预防和治疗...