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高通量筛选平台助肽―人类白细胞抗原pHLA靶向药物安全评估_abio生物试剂品牌网

abiopp8个月前 (06-13)技术84
高通量筛选平台 ValidaTe 助力肽 - 人类白细胞抗原pHLA靶向药物安全评估
--德国M2 点样仪实现微腔芯片的高精准加样

T 细胞受体(T-cell receptor, TCR)疗法、双特异性 T 细胞衔接器(bispecific T-cell engagers, BiTE)等基于肽 - 人类白细胞抗原(peptide-human leukocyte antigen, pHLA)的免疫治疗手段,已逐步在癌症领域展现出巨大潜力,精准评估药物与 pHLA 的结合特异性成为临床前安全评估的关键。然而,仅HLA-I类分子的免疫肽组约至少15 万种 pHLA 复合物,传统技术生物层干涉术(biolayer interferometry, BLI)、微阵列芯片SPR等,单次仅能最多检测96种相互作用,通量低、耗时久,极大的脱靶险。因此,开发超高通量的筛选方法,对于确保 pHLA 靶向治疗药物的安全性和有效性,具有重要的临床意义。

  2023 年 3 月,BioCopy 公司联合 Immatics Biotechnologies公司在《Scientific Reports》发表题为《An ultra-high-throughput screen for the evaluation of peptide HLA-Binder interactions》的文章。在该研究中,构建了一种高通量筛选平台ValidaTe,通过稳定化 pHLA 分子、聚二甲基硅氧烷(polydimethylsiloxan, PDMS)微腔芯片与单色反射干涉技术(highSCORE)的结合,实现对 TCR 与超 500 种 pHLA 复合物相互作用的大规模筛选分析。

实验方法如下:
  1.肽库制备与微腔芯片预处理
  • 合成制备 127 种多肽(含野生型及单氨基酸突变体),经高效液相色谱HPLC纯化后溶于二甲基亚砜(DMSO)/ 水(5%/95%),浓度 200 μg/ml。
  • 微腔芯片(聚二甲基硅氧烷,PDMS 材质):使用M2-Automation 非接触式皮升级/纳升级点样仪iOne,将 300 pl 肽溶液精准点样至 5k-PDMS 芯片的 5226 个微腔中(单个微腔体积 500 pL,直径 150 μm,间距 50 μm)。(图1)
  • 干燥与存储:室温干燥后,芯片于 4℃保存,稳定期可达数月。
2.pHLA 复合物和肽-pHLA微腔芯片
  • pHLA 纯化制备:表达含二硫键稳定化修饰的人类白细胞抗原 A02:01(human leukocyte antigen A02:01, HLA-A*02:01)重链与 β2 微球蛋白(β2-microglobulin, β2m),体外复性后经生物素化修饰(BirA 酶标记),终浓度 200 μg/ml。
  • 肽-pHLA-微腔芯片:通过M2-Automation 非接触式皮升级/纳升级点样仪iOne,向含肽微腔中点样 900 pl HLA 溶液。孵育后,pHLA 复合物通过生物素 - 链霉亲和素(streptavidin, SA)相互作用,转移至预活化的 3D 链霉亲和素修饰玻璃片(highSCORE 芯片)。(图1)
图1肽-pHLA微腔芯片的实验流程图
(1)不同的多肽被点样至微腔芯片的独立微腔中,(2)多肽溶液干燥,(3)阵列可长期储存(4)将生物素化的 HLA 分子点样至各个微腔中发生复合物形成反应,(5)复合物通过生物素 - 链霉亲和素相互作用转移至链霉亲和素(SA)修饰的基底上,(6)用于不同分析物的无标记分析,(7)结合曲线中确定动力学参数。
3.超高通量结合动力学检测
  • 分析物制备:可溶性高亲和力 TCR 分子梯度稀释至 16-480 nM。
  • highSCORE 检测:将肽-pHLA 微腔芯片置于高通量反射干涉仪中,依次进行基线校正(180 s)、结合(250-500 s)、解离(300-600 s)检测,流速 2 μL/s,单次运行生成 5226 条结合曲线。
  • 数据拟合:采用 1:1 结合模型拟合动力学参数(结合速率常数kass、解离速率常数kdiss、平衡解离常数KD),6 次重复实验累计获得超 3 万条有效曲线。
4.与传统技术的对比验证
  • BLI 对照实验:使用 Octet RED384 系统,检测相同 pHLA-TCR 相互作用,对比发现 ValidaTe 平台数据集通量提升650 倍,且KD值相关性良好(R2>0.85),验证了新技术的准确性。(图2)
图2 a) 从 highSCORE 和 BLI 测量获得的KD值之间的相关性;BLI WTKD值显示为蓝色虚线,highSCORE WTKD表示为绿色虚线,箭头突出显示突出的点,灰色的点被排除在线性拟合之外。(b) highSCORE(绿色)和 BLI(蓝色)测量的log10(KD)值的直方图;BLI WTKD值显示为蓝色虚线,highSCORE WTKD表示为绿色虚线。
  研究结论:

1.技术突破:ValidaTe 平台通过微腔芯片与自动化点样技术(M2-Automation 非接触式皮升级/纳升级点样仪iOne),解决了传统微阵列中 pHLA 复合物稳定性差、材料消耗高的难题,单次实验可处理超 500 种不同 pHLA 复合物,未来优化后有望突破 1000 种。

2.效率革命:相较于 BLI 的单次 96 通量得到的数据集,ValidaTe 实现650 倍提升,结合曲线生成速度从小时级缩短至分钟级,大幅降低时间与材料成本(单 spot 材料消耗仅为传统方法的 1/1000)。

3.应用价值成功解析 TCR 与 pHLA 的结合特异性,定位关键氨基酸位点,为药物设计提供精准靶点,推动临床前脱靶风险评估进入 “全谱筛查” 时代。

技术前景与展望

该平台已实现商业化服务(BioCopy),可定制化筛选多种 HLA 亚型及治疗性分子(如 TCR 抗体、BiTE),适用于制药企业、科研机构的早期药物开发。未来计划拓展至细胞水平检测与复合物稳定性分析,助力更多创新型免疫疗法安全落地。

更多信息请参考原文: https://www.nature.com/articles/s41598-023-32384-z

M2-automation位于德国,专注于提供纳升-皮升级超微量点样生物芯片应用领域的解决方案及服务。自公司成立即以来,20年始终致力于开发高精度高灵活性生物样品喷点液体处理平台,
M2系列产品采用接触式/非接触式点样技术,可轻松实现包括但不限于纳米柱、微阵列、微针等各种标准化和个性化生物芯片制备,广泛应用于微流控、生物传感器、临床快检(POCT)等领域。

环亚生物,生命科学产品全国性代理商,具备完善的公司运营、产品管理、营销、售前技术支持和售后维修体系。环亚生物作为M2-automation大中华区代理商,负责相关产品大中华区的营销和售后支持。

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