Nature―瑞士洛桑联邦理工学院：光遗传学的创新性结合揭示肠癌机制_abio生物试剂品牌网
在癌症研究领域，如何精准模拟肿瘤发生的时空动态一直是未解难题。传统的二维培养和动物模型要么缺乏生理复杂性，要么难以实时追踪细胞变化。本文由 瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）Matthias P. Lutolf团队 主导，联合瑞士癌症研究所以及巴塞尔罗氏创新中心等机构完成，发表于《自然》（Nature）。通讯作者L. Francisco Lorenzo-Martín和Matthias P. Lutolf长期致力于干细胞生物工程与肿瘤微环境研究，其团队开发的器官芯片技术在模拟组织生理复杂性领域具有国际领先地位。
研究团队创新性地将微流控芯片技术、光遗传学工具与组织工程方法结合，开发出具有拓扑生物学复杂性的体外微型结肠模型（mini-colons）。
重要发现
光遗传学驱动的体外肿瘤发生模拟
光控Cre重组酶系统：从基因到表型的时空精准操控
研究团队开发的OptoCre系统是一种基于蓝光响应的基因编辑工具，其核心在于将Cre重组酶的表达与光信号耦合。该系统包含三个关键组件：
rtTA转录因子：组成性表达，与多西环素结合后激活下游元件；
GAVPO蛋白：在多西环素存在时表达，蓝光照射下与Cre重组酶结合并激活其功能；
荧光报告基因：通过GFP标记突变细胞，实现单细胞水平的实时追踪。
在实验中，研究人员将OptoCre导入携带Apc、Kras、Trp53突变的结肠类器官（AKP模型），通过蓝光照射（100μW/cm²，3小时）诱导特定细胞的致癌重组。结果显示，蓝光照射区域的细胞迅速启动突变程序，而未照射区域保持正常，证明该系统具有亚细胞级的空间控制精度。
迷你结肠：光遗传学与微流控技术的完美融合传统类器官因结构封闭、寿命短，难以模拟肿瘤长期演化。而微流控迷你结肠通过支架引导的类器官形态发生，形成了类似体内结肠的开放管腔结构，具备三大优势：
长期培养能力 ：无需传代即可维持数周，允许观察肿瘤从启动到侵袭的完整时间线；
细胞空间分区 ：隐窝区域富集干细胞（Lgr5+、SOX9+），管腔侧分布分化细胞（FABP1+），重现体内组织极性；
光信号穿透性 ：透明水凝胶支架允许蓝光均匀照射，结合光掩膜技术可精准定位突变区域（如仅照射<0.5%的细胞）。
通过OptoCre与迷你结肠的结合，研究团队首次在体外观察到：
早期细胞竞争：突变细胞在蓝光照射后24-72小时内经历凋亡高峰，但少数细胞逃逸并进入快速增殖状态；
肿瘤形态发生：从息肉样结构（5-10天）逐步演变为侵袭性肿瘤，表达CD44+癌症干细胞标记，与体内腺癌组织学特征高度吻合。
肿瘤异质性的光控解析利用光掩膜技术，研究人员对比了隐窝和管腔上皮细胞作为肿瘤起始位点的差异：
隐窝起源肿瘤 ：呈现致密结构，富含干细胞标记（Lgr5+、SOX9+），转录谱与体内癌症干细胞高度相似；
管腔起源肿瘤 ：形成囊性结构，分化标记（FABP1+）表达较高，增殖能力较弱。
这一结果表明，肿瘤起始微环境决定了其形态和功能异质性，而光遗传学技术为解析这种“环境-基因型”互作提供了可控平台。
创新与亮点
技术突破：从“黑箱”到“透明实验室”
传统肿瘤研究依赖动物模型，面临三大瓶颈：
时空分辨率不足：无法实时追踪单细胞动态；
伦理与成本：动物实验周期长、成本高，且难以大规模筛选；
生理相关性差：二维培养或简单类器官无法模拟组织复杂性。
光遗传学与迷你结肠的结合突破了上述限制：
时空操控革命：蓝光照射可在分钟级激活突变，配合延时摄影实现“肿瘤发生电影”的全程记录；
生理相关性跃升：迷你结肠包含8种主要细胞类型，覆盖干细胞、分化细胞和分泌细胞，其转录谱与体内结肠组织的相关性达89%；
高通量潜力：微流控装置可并行培养多个迷你结肠，结合自动化成像系统，适合大规模药物筛选。
科学价值：揭开肿瘤起始的“黑匣子”
该研究首次在体外复现了结直肠癌的多阶段演化模型，并通过光遗传学技术验证了关键科学假设：
肿瘤起始的“细胞死亡-逃逸”假说：突变早期的细胞凋亡是清除异常细胞的关键机制，而逃逸细胞的克隆扩张依赖WNT信号通路激活；
代谢微环境的调控作用：通过光控诱导不同分化状态的细胞，发现谷胱甘肽过氧化物酶GPX2是维持癌症干细胞干性的关键因子，其抑制剂硫普罗宁可显著抑制肿瘤形成；
菌群代谢物的远程调控：利用迷你结肠的开放管腔，证实胆汁酸代谢物脱氧胆酸可通过管腔侧接触促进肿瘤生长，而丁酸等抑癌代谢物则通过相同路径发挥作用。
总结与展望
光遗传学迷你结肠模型的诞生，标志着肿瘤研究进入“精准操控”的新纪元。这项技术通过光信号将基因编辑、细胞追踪与组织工程无缝整合，不仅在体外复现了肿瘤发生的时空复杂性，更赋予研究者“主动创造”肿瘤微环境的能力。尽管当前模型尚未整合免疫细胞与血管系统，且对多阶段突变的模拟仍需优化，但它已在药物筛选（如GPX2抑制剂验证）、个性化医疗（患者类器官药敏测试）等领域展现出颠覆性潜力。未来，随着光遗传学工具的迭代（如近红外光激活系统）与类器官技术的升级（血管化、神经支配），这种“可编程”的体外肿瘤模型有望成为替代动物实验的核心平台，让癌症研究从“依赖偶然观察”转向“设计驱动发现”，最终为攻克肿瘤异质性与精准医疗提供关键钥匙。
声明：本文仅用作学术目的。
文章来源于：
Lorenzo-Martín LF, Hübscher T, Bowler AD, Broguiere N, Langer J, Tillard L, Nikolaev M, Radtke F, Lutolf MP. Spatiotemporally resolved colorectal oncogenesis in mini-colons ex vivo. Nature. 2024 May;629(8011):450-457.
DOI:10.1038/s41586-024-07330-2.
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