卵巢癌是一种预后极差的妇科恶性肿瘤，5年生存率低于50%。尽管免疫治疗在多种癌症中取得成功，但在卵巢癌中的效果有限。既往研究发现，卵巢癌组织中CD3+和CD8+ T细胞的浸润与预后相关，但具体抗原尚不明确。近期研究显示，HLA I类分子可呈递非编码区域产生的隐秘肽，这些肽段可能成为潜在的肿瘤特异性抗原。本研究旨在探索这些隐秘肽段的免疫原性及其在卵巢癌中的作用。   ▶ 发表时间：2025年3月13日 ▶ 期刊：《Science Advances》 ▶ 发表团队：梅奥诊所等团队 ▶ 文章标题：Immunogenic cryptic peptides dominate the antigenic landscape of ovarian cancer ▶ 核心内容：研究通过免疫肽组学和RNA测序，从5例卵巢癌患者的肿瘤样本中鉴定出311个隐秘肽段，其中70%能够激活自体CD8+ T细胞，表现出显著的免疫原性。研究还发现，这些肽段在其他癌症类型中也有一定的共享性，表明它们可能是一个丰富的免疫治疗靶点来源。这些发现为开发针对卵巢癌的个性化免疫疗法提供了新的方向。 Part1. 实验设计 研究者从5例晚期卵巢癌患者中收集肿瘤组织、相邻正常组织和腹水样本，进行RNA测序和免疫肽组检测。利用免疫肽组学技术，富集并鉴定HLA I类分子呈递的肽段，结合RNA测序构建的个性化蛋白数据库，筛选出非编码区域产生的隐秘肽段。通过体外T细胞刺激实验，评估这些隐秘肽段的免疫原性，检测其激活自体CD8+ T细胞的能力。此外，研究还利用公共数据库分析隐秘肽段在其他肿瘤中的表达情况，以评估其作为免疫治疗靶点的潜力。整个实验设计涵盖了从样本收集到功能验证的全过程，为发现新的肿瘤抗原提供了有力支持。 图1. 文章实验思路和设计   Part2. 研究结果
一、HLA I免疫肽组学检测： 通过免疫肽组学分析，研究者从5例卵巢癌患者的肿瘤样本中鉴定了HLA I类分子呈递的肽段。这些肽段的长度分布符合预期，且与患者的HLA类型匹配。实验结果表明，免疫肽组学分析能够准确鉴定与HLA I类分子结合的肽段，为后续研究奠定了基础。 图2. HLA I型免疫肽的检测结果     二、隐秘肽的鉴定 研究者利用RNA测序和质谱分析，从5例患者的肿瘤样本中鉴定出311个隐秘肽段，平均每位患者约60个。这些隐秘肽段主要来源于非编码区域，如假基因、长非编码RNA和反义RNA。尽管这些肽段在总免疫肽组中占比不到1%，但它们是主要的抗原类别。 图3. 卵巢癌中隐秘肽鉴定     三、非编码的隐秘肽是卵巢癌主要呈递的抗原类别 研究发现，隐秘肽段在卵巢癌中的抗原性显著高于其他已知的肿瘤特异性和肿瘤相关抗原。这些隐秘肽段在不同患者之间有一定的共享性，并且在其他癌症类型中也有发现。这表明隐秘肽段可能是一个丰富的免疫治疗靶点来源。 图4. 非编码转录本中的隐秘抗原是肿瘤抗原的可靠来源     四、候选隐秘肽抗原的筛选 研究者筛选出具有高结合亲和力和肿瘤特异性的隐秘肽段。这些肽段在肿瘤组织中的表达水平显著高于正常组织，且在正常组织中很少或不表达。通过这些筛选步骤，研究者成功鉴定了9到10个具有免疫原性的隐秘肽段，为后续的功能验证提供了候选靶点。    图5. 候选抗原肽筛选的流程     五、免疫原性的验证 研究者通过体外T细胞刺激实验，发现约70%的隐秘肽段能够激活自体CD8+ T细胞，表现为4-1BB和IFN-γ表达增加。此外，研究还通过肽-MHC四聚体检测到针对这些隐秘肽段的特异性CD8+ T细胞克隆。这些结果表明，隐秘肽段具有显著的免疫原性，能够激发T细胞反应。 图6. 非编码隐秘抗原能够激活患者来源的T细胞   Part3. 研究小结 本研究通过免疫肽组学和RNA测序，从5例卵巢癌患者的肿瘤样本中鉴定出311个隐秘肽段，其中70%能够激活自体CD8+ T细胞，表现出显著的免疫原性。这些发现为开发针对卵巢癌的个性化免疫疗法提供了新的方向，尤其是在传统免疫治疗效果不佳的患者中。未来的研究需要进一步探索隐秘肽段在其他癌症类型中的作用，并评估其作为免疫治疗靶点的潜力。